城市生態(tài)修復的過程,是以生態(tài)城市為發(fā)展目標,對城市現(xiàn)有的物質(zhì)環(huán)境進行優(yōu)化更新,恢復城市生態(tài)系統(tǒng)的功能,促進城市社會、經(jīng)濟、自然系統(tǒng)協(xié)調(diào)、有序狀態(tài)演進的過程城市生態(tài)系統(tǒng)的退化往往是因為多種生態(tài)要素和生態(tài)功能的退化,對于區(qū)域生態(tài)修復工程,需辨析系統(tǒng)退化的主導因素,發(fā)現(xiàn)環(huán)境惡化的主要問題,從而確定主要的恢復對象和工程內(nèi)容。

國外的城市生態(tài)修復工程常常是結合生態(tài)規(guī)劃同時進行,在完成生態(tài)系統(tǒng)功能修復的同時,實現(xiàn)城市的有機更新,將生態(tài)規(guī)劃、環(huán)境整治、生態(tài)恢復一系列方法結合,營建自然協(xié)調(diào)的城市環(huán)境,并通過廣泛的公眾參與加強生態(tài)恢復成果的效應。

城市生態(tài)系統(tǒng)不同于自然界的生態(tài)系統(tǒng)，系統(tǒng)內(nèi)部的結構、功能較自然界簡單，城市生態(tài)修復一般認為包含四個方面的內(nèi)容：山地生態(tài)修復、水體生態(tài)修復、棕地生態(tài)修復、綠地系統(tǒng)生態(tài)修復。城市水體參考成因的自然屬性進行分類，可分為四個類型：河流、湖泊、濕地、濱海。

修復的目標難以確定。退化生態(tài)系統(tǒng)修復可能的發(fā)展方向。保持生態(tài)系統(tǒng)的原狀、減慢生態(tài)系統(tǒng)的退化、生態(tài)系統(tǒng)退化前的狀態(tài)、介于生態(tài)系統(tǒng)退化前與原狀之間的狀態(tài)。人們從事的生態(tài)修復目標定為哪個階段，為什么定于這個階段難以界定。

生態(tài)修復技術難度較大。生態(tài)系統(tǒng)的修復是一個“私人定制”需要因地制宜的過程。河流的生態(tài)修復與山體的生態(tài)修復從目標、對象、技術手法有根本的區(qū)別。即使同是城市河流生態(tài)修復，大江與小河的修復手法也不同；河流動植物的發(fā)育階段不同，修復方法也有差別。所以，生態(tài)修復的技術難度較大，需要針對不同的問題做專門的研究調(diào)查，一對一定制。

難以客觀準確的進行修復后的評價。生態(tài)修復作為針對自然過程的一項工作，沒有一定的技術手段，是一項極為困難的工作，修復以后針對不同的評價標準，有較大的評價結果差別，目前從世界范圍看，修復效果評價臨巨大挑戰(zhàn)。尤其是我國的生態(tài)修復工作，缺乏相關系統(tǒng)數(shù)據(jù)支撐。

水量減少。城市人口增加、產(chǎn)業(yè)用水劇增，導致水量減少；水利工程設施的建設造成江河湖泊的阻隔，彼此之間失去了系統(tǒng)的聯(lián)系，造成水量減少。使城市水系統(tǒng)的水文條件等發(fā)生變化。

水體的污染。由于人類活動而排放的污染物進入河流水體，超過了河流的自凈能力，使水體和底泥的物理、化學、生物性質(zhì)發(fā)生變化，從而降低了水體的使用價值，使水系統(tǒng)結構和功能發(fā)生改變。

植被退化，動物棲息地被破壞。城市對水資源的利用強度和對水環(huán)境的干擾力度不斷增加，水生態(tài)系統(tǒng)植被緩沖帶的植物減少，整體的植被出現(xiàn)退化，導致動物棲息地破碎化，引起適宜生境空間格局的變化。

城市生態(tài)景觀缺失。原本清澈的河流水量減少，水體被污染，植被退化、動物棲息地被破壞、固體廢棄物等丟棄，污水留下黑色的沉淀物，嚴重損害了城市生態(tài)景觀。